Près de 80 % des espèces animales et végétales recensées dans tout le Nord-Pas de Calais peuvent être observées sur le territoire des Caps et Marais d’Opale. Le Parc naturel régional mène et organise des actions de protection de la biodiversité, via des inventaires et des suivis d’espèces de faune et de flore. Des espaces favorables à la biodiversité, coins nature et mares, sont également créés sur le territoire.